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本單元依真菌中文名稱之筆劃順序排列
 
接合菌類 *  
  * 水玉黴 Pilobolus crystallinus
  * 放射毛黴 Actinomucor elegans
  * 簇生繡球菌 Glomus fasiculatum
  * 鬍鬚黴 Phycomyces nitens
  * 麵包黴 Rhizopus stolonifer
子囊菌類 *  
  * 冬蟲夏草 Cordyceps sinensis
  * 紫紅麴 Monascus purpureus
  * 臺灣塊菇 Tuber formosanum
  * 蕉座炭角菌 Xylaria allantoidea
  * 釀酒酵母 Saccharomyces cerevisiae
擔子菌類 *  
  * 巴西蘑菇 Agaricus blazi
  * 木耳 Auricularia auricula
  * 毛頭鬼傘 Coprinus comatus
  * 巨大口蘑 Tricholoma giganteum
  * 白木耳 Tremella fuciformis
  * 竹蓀 Dictyophroa indusiata
  * 金針菇 Flammulina velutipes
  * 柳松菇 Agrocybe cylindracea
  * 洋菇 Agaricus bisporus
  * 紅苞鵝膏 Amanita rubrovolvata
  * 香菇 Lentinus edodes
  * 草菇 Volvariella volvacea
  * 茯苓 Wolfiporia cocos
  * 彩色豆馬勃 Pisolithus tinctorius
  * 猴頭菇 Hericium erinaceum
  * 菰黑穗菌 Ustilago esculenta
  * 綠褶菇 Chlorophyllum molybdites
  * 網紋馬勃 Lycoperdon perlatum
  * 臺灣松茸 Tricholoma matsutake var. formosana
  * 舞菇 Grifola frondosua
  * 雞肉絲菇 Termitomyces albuminosus
  * 蜜環菌 Armillaria mellea
  * 鮑魚菇 Pleurotus cystidiosus
  * 靈芝 Ganoderma lucidum
不完全菌 *  
  * 白僵菌 Beauveria bassiana
  * 青黴菌 Penicillium chrysogenum
  * 黃麴菌 Aspergillus flavus
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